Provádí výkon rozhodnutí orgánů Svazu a zajišťuje naplňování priorit Svazu daných Sněmem. Zpracovává stanoviska Svazu k návrhům právních předpisů, koncepcí, programů a dalších dokumentů souvisejících s životem měst a obcí. Zajišťuje administrativní podporu ostatním orgánům Svazu. Organizuje semináře, konference a krajská setkání. V čele Kanceláře stojí výkonný místopředseda. Kancelář je tvořena odděleními: vnitřních věcí, vnějších vztahů a legislativně-právním.
Odd. vnitřních věcí
Zajišťuje po organizační a provozně technické stránce činnost orgánů Svazu a komisí Svazu, akce pořádané Svazem (např. krajská setkání, finanční konferenci a kongres starostů), vede evidenci obcí, zajišťuje provozně-ekonomický chod Kanceláře.
Odd. vnějších vztahů
Oddělení vnějších vztahů zajišťuje:
- Agendu zahraničních vztahů – připravuje jednání zástupců Svazu v evropských institucích. Poskytuje informace k čerpání evropských fondů a aktivně ovlivňuje podobu kohezní politiky EU. Poskytuje poradenství v oblasti partnerské spolupráce měst a zprostředkovává nová partnerství.
- Agendu PR a komunikace – připravuje pro členy Svazu pravidelný informační měsíčník a elektronický zpravodaj, spravuje webové stránky, spolupracuje na vydávání odborných publikací a zajišťuje komunikaci s médii.
Odd. legislativně-právní
Připomínkuje návrhy právních předpisů, které se dotýkají obcí, a vyjednává o nich na jednotlivých ministerstvech, ministerských pracovních skupinách a v Parlamentu. Prostřednictvím členství Svazu v CEMR a bruselského pracoviště Svazu vstupuje do procesu ovlivňování legislativních norem a politik Evropské unie. Po odborné stránce zajišťuje chod pracovních komisí Předsednictva Svazu a jednotlivých komor, vydává právní stanoviska a poskytuje právní konzultace pro členské obce.